James Moger
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/*
 * Copyright 2011 gitblit.com.
 *
 * Licensed under the Apache License, Version 2.0 (the "License");
 * you may not use this file except in compliance with the License.
 * You may obtain a copy of the License at
 *
 *     http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
 *
 * Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
 * distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
 * WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
 * See the License for the specific language governing permissions and
 * limitations under the License.
 */
package com.gitblit;
 
import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.FileFilter;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;
import java.lang.reflect.Field;
import java.text.MessageFormat;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.Collections;
import java.util.HashMap;
import java.util.List;
import java.util.Map;
import java.util.Map.Entry;
import java.util.TreeMap;
import java.util.concurrent.ConcurrentHashMap;
import java.util.concurrent.Executors;
import java.util.concurrent.ScheduledExecutorService;
import java.util.concurrent.TimeUnit;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicInteger;
 
import javax.mail.Message;
import javax.mail.MessagingException;
import javax.servlet.ServletContext;
import javax.servlet.ServletContextEvent;
import javax.servlet.ServletContextListener;
import javax.servlet.http.Cookie;
 
import org.apache.wicket.protocol.http.WebResponse;
import org.eclipse.jgit.errors.RepositoryNotFoundException;
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
import org.eclipse.jgit.lib.RepositoryCache.FileKey;
import org.eclipse.jgit.lib.StoredConfig;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.FileResolver;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.RepositoryResolver;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.ServiceNotAuthorizedException;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.ServiceNotEnabledException;
import org.eclipse.jgit.util.FS;
import org.eclipse.jgit.util.FileUtils;
import org.slf4j.Logger;
import org.slf4j.LoggerFactory;
 
import com.gitblit.Constants.AccessRestrictionType;
import com.gitblit.Constants.FederationRequest;
import com.gitblit.Constants.FederationStrategy;
import com.gitblit.Constants.FederationToken;
import com.gitblit.models.FederationModel;
import com.gitblit.models.FederationProposal;
import com.gitblit.models.FederationSet;
import com.gitblit.models.Metric;
import com.gitblit.models.ObjectCache;
import com.gitblit.models.RepositoryModel;
import com.gitblit.models.ServerStatus;
import com.gitblit.models.SettingModel;
import com.gitblit.models.UserModel;
import com.gitblit.utils.ByteFormat;
import com.gitblit.utils.FederationUtils;
import com.gitblit.utils.JGitUtils;
import com.gitblit.utils.JsonUtils;
import com.gitblit.utils.MetricUtils;
import com.gitblit.utils.StringUtils;
 
/**
 * GitBlit is the servlet context listener singleton that acts as the core for
 * the web ui and the servlets. This class is either directly instantiated by
 * the GitBlitServer class (Gitblit GO) or is reflectively instantiated from the
 * definition in the web.xml file (Gitblit WAR).
 * 
 * This class is the central logic processor for Gitblit. All settings, user
 * object, and repository object operations pass through this class.
 * 
 * Repository Resolution. There are two pathways for finding repositories. One
 * pathway, for web ui display and repository authentication & authorization, is
 * within this class. The other pathway is through the standard GitServlet.
 * 
 * @author James Moger
 * 
 */
public class GitBlit implements ServletContextListener {
 
    private static GitBlit gitblit;
 
    private final Logger logger = LoggerFactory.getLogger(GitBlit.class);
 
    private final ScheduledExecutorService scheduledExecutor = Executors.newScheduledThreadPool(5);
 
    private final List<FederationModel> federationRegistrations = Collections
            .synchronizedList(new ArrayList<FederationModel>());
 
    private final Map<String, FederationModel> federationPullResults = new ConcurrentHashMap<String, FederationModel>();
 
    private final ObjectCache<Long> repositorySizeCache = new ObjectCache<Long>();
 
    private final ObjectCache<List<Metric>> repositoryMetricsCache = new ObjectCache<List<Metric>>();
 
    private RepositoryResolver<Void> repositoryResolver;
 
    private ServletContext servletContext;
 
    private File repositoriesFolder;
 
    private boolean exportAll = true;
 
    private IUserService userService;
 
    private IStoredSettings settings;
 
    private Map<String, SettingModel> settingModels;
 
    private ServerStatus serverStatus;
 
    private MailExecutor mailExecutor;
 
    public GitBlit() {
        if (gitblit == null) {
            // set the static singleton reference
            gitblit = this;
        }
    }
 
    /**
     * Returns the Gitblit singleton.
     * 
     * @return gitblit singleton
     */
    public static GitBlit self() {
        if (gitblit == null) {
            new GitBlit();
        }
        return gitblit;
    }
 
    /**
     * Determine if this is the GO variant of Gitblit.
     * 
     * @return true if this is the GO variant of Gitblit.
     */
    public static boolean isGO() {
        return self().settings instanceof FileSettings;
    }
 
    /**
     * Returns the boolean value for the specified key. If the key does not
     * exist or the value for the key can not be interpreted as a boolean, the
     * defaultValue is returned.
     * 
     * @see IStoredSettings.getBoolean(String, boolean)
     * @param key
     * @param defaultValue
     * @return key value or defaultValue
     */
    public static boolean getBoolean(String key, boolean defaultValue) {
        return self().settings.getBoolean(key, defaultValue);
    }
 
    /**
     * Returns the integer value for the specified key. If the key does not
     * exist or the value for the key can not be interpreted as an integer, the
     * defaultValue is returned.
     * 
     * @see IStoredSettings.getInteger(String key, int defaultValue)
     * @param key
     * @param defaultValue
     * @return key value or defaultValue
     */
    public static int getInteger(String key, int defaultValue) {
        return self().settings.getInteger(key, defaultValue);
    }
 
    /**
     * Returns the char value for the specified key. If the key does not exist
     * or the value for the key can not be interpreted as a character, the
     * defaultValue is returned.
     * 
     * @see IStoredSettings.getChar(String key, char defaultValue)
     * @param key
     * @param defaultValue
     * @return key value or defaultValue
     */
    public static char getChar(String key, char defaultValue) {
        return self().settings.getChar(key, defaultValue);
    }
 
    /**
     * Returns the string value for the specified key. If the key does not exist
     * or the value for the key can not be interpreted as a string, the
     * defaultValue is returned.
     * 
     * @see IStoredSettings.getString(String key, String defaultValue)
     * @param key
     * @param defaultValue
     * @return key value or defaultValue
     */
    public static String getString(String key, String defaultValue) {
        return self().settings.getString(key, defaultValue);
    }
 
    /**
     * Returns a list of space-separated strings from the specified key.
     * 
     * @see IStoredSettings.getStrings(String key)
     * @param name
     * @return list of strings
     */
    public static List<String> getStrings(String key) {
        return self().settings.getStrings(key);
    }
 
    /**
     * Returns the list of keys whose name starts with the specified prefix. If
     * the prefix is null or empty, all key names are returned.
     * 
     * @see IStoredSettings.getAllKeys(String key)
     * @param startingWith
     * @return list of keys
     */
 
    public static List<String> getAllKeys(String startingWith) {
        return self().settings.getAllKeys(startingWith);
    }
 
    /**
     * Is Gitblit running in debug mode?
     * 
     * @return true if Gitblit is running in debug mode
     */
    public static boolean isDebugMode() {
        return self().settings.getBoolean(Keys.web.debugMode, false);
    }
 
    public ServerStatus getStatus() {
        // update heap memory status
        serverStatus.heapAllocated = Runtime.getRuntime().totalMemory();
        serverStatus.heapFree = Runtime.getRuntime().freeMemory();
        return serverStatus;
    }
 
    /**
     * Returns the list of non-Gitblit clone urls. This allows Gitblit to
     * advertise alternative urls for Git client repository access.
     * 
     * @param repositoryName
     * @return list of non-gitblit clone urls
     */
    public List<String> getOtherCloneUrls(String repositoryName) {
        List<String> cloneUrls = new ArrayList<String>();
        for (String url : settings.getStrings(Keys.web.otherUrls)) {
            cloneUrls.add(MessageFormat.format(url, repositoryName));
        }
        return cloneUrls;
    }
 
    /**
     * Set the user service. The user service authenticates all users and is
     * responsible for managing user permissions.
     * 
     * @param userService
     */
    public void setUserService(IUserService userService) {
        logger.info("Setting up user service " + userService.toString());
        this.userService = userService;
        this.userService.setup(settings);
    }
 
    /**
     * Authenticate a user based on a username and password.
     * 
     * @see IUserService.authenticate(String, char[])
     * @param username
     * @param password
     * @return a user object or null
     */
    public UserModel authenticate(String username, char[] password) {
        if (StringUtils.isEmpty(username)) {
            // can not authenticate empty username
            return null;
        }
        String pw = new String(password);
        if (StringUtils.isEmpty(pw)) {
            // can not authenticate empty password
            return null;
        }
 
        // check to see if this is the federation user
        if (canFederate()) {
            if (username.equalsIgnoreCase(Constants.FEDERATION_USER)) {
                List<String> tokens = getFederationTokens();
                if (tokens.contains(pw)) {
                    // the federation user is an administrator
                    UserModel federationUser = new UserModel(Constants.FEDERATION_USER);
                    federationUser.canAdmin = true;
                    return federationUser;
                }
            }
        }
 
        // delegate authentication to the user service
        if (userService == null) {
            return null;
        }
        return userService.authenticate(username, password);
    }
 
    /**
     * Authenticate a user based on their cookie.
     * 
     * @param cookies
     * @return a user object or null
     */
    public UserModel authenticate(Cookie[] cookies) {
        if (userService == null) {
            return null;
        }
        if (userService.supportsCookies()) {
            if (cookies != null && cookies.length > 0) {
                for (Cookie cookie : cookies) {
                    if (cookie.getName().equals(Constants.NAME)) {
                        String value = cookie.getValue();
                        return userService.authenticate(value.toCharArray());
                    }
                }
            }
        }
        return null;
    }
 
    /**
     * Sets a cookie for the specified user.
     * 
     * @param response
     * @param user
     */
    public void setCookie(WebResponse response, UserModel user) {
        if (userService == null) {
            return;
        }
        if (userService.supportsCookies()) {
            Cookie userCookie;
            if (user == null) {
                // clear cookie for logout
                userCookie = new Cookie(Constants.NAME, "");
            } else {
                // set cookie for login
                char[] cookie = userService.getCookie(user);
                userCookie = new Cookie(Constants.NAME, new String(cookie));
                userCookie.setMaxAge(Integer.MAX_VALUE);
            }
            userCookie.setPath("/");
            response.addCookie(userCookie);
        }
    }
 
    /**
     * Returns the list of all users available to the login service.
     * 
     * @see IUserService.getAllUsernames()
     * @return list of all usernames
     */
    public List<String> getAllUsernames() {
        List<String> names = new ArrayList<String>(userService.getAllUsernames());
        Collections.sort(names);
        return names;
    }
 
    /**
     * Delete the user object with the specified username
     * 
     * @see IUserService.deleteUser(String)
     * @param username
     * @return true if successful
     */
    public boolean deleteUser(String username) {
        return userService.deleteUser(username);
    }
 
    /**
     * Retrieve the user object for the specified username.
     * 
     * @see IUserService.getUserModel(String)
     * @param username
     * @return a user object or null
     */
    public UserModel getUserModel(String username) {
        UserModel user = userService.getUserModel(username);
        return user;
    }
 
    /**
     * Returns the list of all users who are allowed to bypass the access
     * restriction placed on the specified repository.
     * 
     * @see IUserService.getUsernamesForRepositoryRole(String)
     * @param repository
     * @return list of all usernames that can bypass the access restriction
     */
    public List<String> getRepositoryUsers(RepositoryModel repository) {
        return userService.getUsernamesForRepositoryRole(repository.name);
    }
 
    /**
     * Sets the list of all uses who are allowed to bypass the access
     * restriction placed on the specified repository.
     * 
     * @see IUserService.setUsernamesForRepositoryRole(String, List<String>)
     * @param repository
     * @param usernames
     * @return true if successful
     */
    public boolean setRepositoryUsers(RepositoryModel repository, List<String> repositoryUsers) {
        return userService.setUsernamesForRepositoryRole(repository.name, repositoryUsers);
    }
 
    /**
     * Adds/updates a complete user object keyed by username. This method allows
     * for renaming a user.
     * 
     * @see IUserService.updateUserModel(String, UserModel)
     * @param username
     * @param user
     * @param isCreate
     * @throws GitBlitException
     */
    public void updateUserModel(String username, UserModel user, boolean isCreate)
            throws GitBlitException {
        if (!userService.updateUserModel(username, user)) {
            throw new GitBlitException(isCreate ? "Failed to add user!" : "Failed to update user!");
        }
    }
 
    /**
     * Clears all the cached data for the specified repository.
     * 
     * @param repositoryName
     */
    public void clearRepositoryCache(String repositoryName) {
        repositorySizeCache.remove(repositoryName);
        repositoryMetricsCache.remove(repositoryName);
    }
 
    /**
     * Returns the list of all repositories available to Gitblit. This method
     * does not consider user access permissions.
     * 
     * @return list of all repositories
     */
    public List<String> getRepositoryList() {
        return JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder, exportAll,
                settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true));
    }
 
    /**
     * Returns the JGit repository for the specified name.
     * 
     * @param repositoryName
     * @return repository or null
     */
    public Repository getRepository(String repositoryName) {
        Repository r = null;
        try {
            r = repositoryResolver.open(null, repositoryName);
        } catch (RepositoryNotFoundException e) {
            r = null;
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                    + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath());
        } catch (ServiceNotAuthorizedException e) {
            r = null;
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                    + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
        } catch (ServiceNotEnabledException e) {
            r = null;
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                    + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
        }
        return r;
    }
 
    /**
     * Returns the list of repository models that are accessible to the user.
     * 
     * @param user
     * @return list of repository models accessible to user
     */
    public List<RepositoryModel> getRepositoryModels(UserModel user) {
        List<String> list = getRepositoryList();
        List<RepositoryModel> repositories = new ArrayList<RepositoryModel>();
        for (String repo : list) {
            RepositoryModel model = getRepositoryModel(user, repo);
            if (model != null) {
                repositories.add(model);
            }
        }
        if (getBoolean(Keys.web.showRepositorySizes, true)) {
            int repoCount = 0;
            long startTime = System.currentTimeMillis();
            ByteFormat byteFormat = new ByteFormat();
            for (RepositoryModel model : repositories) {
                if (!model.skipSizeCalculation) {
                    repoCount++;
                    model.size = byteFormat.format(calculateSize(model));
                }
            }
            long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
            logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
                    repoCount, duration));
        }
        return repositories;
    }
 
    /**
     * Returns a repository model if the repository exists and the user may
     * access the repository.
     * 
     * @param user
     * @param repositoryName
     * @return repository model or null
     */
    public RepositoryModel getRepositoryModel(UserModel user, String repositoryName) {
        RepositoryModel model = getRepositoryModel(repositoryName);
        if (model == null) {
            return null;
        }
        if (model.accessRestriction.atLeast(AccessRestrictionType.VIEW)) {
            if (user != null && user.canAccessRepository(model.name)) {
                return model;
            }
            return null;
        } else {
            return model;
        }
    }
 
    /**
     * Returns the repository model for the specified repository. This method
     * does not consider user access permissions.
     * 
     * @param repositoryName
     * @return repository model or null
     */
    public RepositoryModel getRepositoryModel(String repositoryName) {
        Repository r = getRepository(repositoryName);
        if (r == null) {
            return null;
        }
        RepositoryModel model = new RepositoryModel();
        model.name = repositoryName;
        model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
        model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r, null);
        StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
        if (config != null) {
            model.description = getConfig(config, "description", "");
            model.owner = getConfig(config, "owner", "");
            model.useTickets = getConfig(config, "useTickets", false);
            model.useDocs = getConfig(config, "useDocs", false);
            model.accessRestriction = AccessRestrictionType.fromName(getConfig(config,
                    "accessRestriction", null));
            model.showRemoteBranches = getConfig(config, "showRemoteBranches", false);
            model.isFrozen = getConfig(config, "isFrozen", false);
            model.showReadme = getConfig(config, "showReadme", false);
            model.skipSizeCalculation = getConfig(config, "skipSizeCalculation", false);
            model.federationStrategy = FederationStrategy.fromName(getConfig(config,
                    "federationStrategy", null));
            model.federationSets = new ArrayList<String>(Arrays.asList(config.getStringList(
                    "gitblit", null, "federationSets")));
            model.isFederated = getConfig(config, "isFederated", false);
            model.origin = config.getString("remote", "origin", "url");
        }
        r.close();
        return model;
    }
 
    /**
     * Returns the size in bytes of the repository. Gitblit caches the
     * repository sizes to reduce the performance penalty of recursive
     * calculation. The cache is updated if the repository has been changed
     * since the last calculation.
     * 
     * @param model
     * @return size in bytes
     */
    public long calculateSize(RepositoryModel model) {
        if (repositorySizeCache.hasCurrent(model.name, model.lastChange)) {
            return repositorySizeCache.getObject(model.name);
        }
        File gitDir = FileKey.resolve(new File(repositoriesFolder, model.name), FS.DETECTED);
        long size = com.gitblit.utils.FileUtils.folderSize(gitDir);
        repositorySizeCache.updateObject(model.name, model.lastChange, size);
        return size;
    }
 
    /**
     * Ensure that a cached repository is completely closed and its resources
     * are properly released.
     * 
     * @param repositoryName
     */
    private void closeRepository(String repositoryName) {
        Repository repository = getRepository(repositoryName);
        // assume 2 uses in case reflection fails
        int uses = 2;
        try {
            // The FileResolver caches repositories which is very useful
            // for performance until you want to delete a repository.
            // I have to use reflection to call close() the correct
            // number of times to ensure that the object and ref databases
            // are properly closed before I can delete the repository from
            // the filesystem.
            Field useCnt = Repository.class.getDeclaredField("useCnt");
            useCnt.setAccessible(true);
            uses = ((AtomicInteger) useCnt.get(repository)).get();
        } catch (Exception e) {
            logger.warn(MessageFormat
                    .format("Failed to reflectively determine use count for repository {0}",
                            repositoryName), e);
        }
        if (uses > 0) {
            logger.info(MessageFormat
                    .format("{0}.useCnt={1}, calling close() {2} time(s) to close object and ref databases",
                            repositoryName, uses, uses));
            for (int i = 0; i < uses; i++) {
                repository.close();
            }
        }
    }
 
    /**
     * Returns the metrics for the default branch of the specified repository.
     * This method builds a metrics cache. The cache is updated if the
     * repository is updated. A new copy of the metrics list is returned on each
     * call so that modifications to the list are non-destructive.
     * 
     * @param model
     * @param repository
     * @return a new array list of metrics
     */
    public List<Metric> getRepositoryDefaultMetrics(RepositoryModel model, Repository repository) {
        if (repositoryMetricsCache.hasCurrent(model.name, model.lastChange)) {
            return new ArrayList<Metric>(repositoryMetricsCache.getObject(model.name));
        }
        List<Metric> metrics = MetricUtils.getDateMetrics(repository, null, true, null);
        repositoryMetricsCache.updateObject(model.name, model.lastChange, metrics);
        return new ArrayList<Metric>(metrics);
    }
 
    /**
     * Returns the gitblit string value for the specified key. If key is not
     * set, returns defaultValue.
     * 
     * @param config
     * @param field
     * @param defaultValue
     * @return field value or defaultValue
     */
    private String getConfig(StoredConfig config, String field, String defaultValue) {
        String value = config.getString("gitblit", null, field);
        if (StringUtils.isEmpty(value)) {
            return defaultValue;
        }
        return value;
    }
 
    /**
     * Returns the gitblit boolean vlaue for the specified key. If key is not
     * set, returns defaultValue.
     * 
     * @param config
     * @param field
     * @param defaultValue
     * @return field value or defaultValue
     */
    private boolean getConfig(StoredConfig config, String field, boolean defaultValue) {
        return config.getBoolean("gitblit", field, defaultValue);
    }
 
    /**
     * Creates/updates the repository model keyed by reopsitoryName. Saves all
     * repository settings in .git/config. This method allows for renaming
     * repositories and will update user access permissions accordingly.
     * 
     * All repositories created by this method are bare and automatically have
     * .git appended to their names, which is the standard convention for bare
     * repositories.
     * 
     * @param repositoryName
     * @param repository
     * @param isCreate
     * @throws GitBlitException
     */
    public void updateRepositoryModel(String repositoryName, RepositoryModel repository,
            boolean isCreate) throws GitBlitException {
        Repository r = null;
        if (isCreate) {
            // ensure created repository name ends with .git
            if (!repository.name.toLowerCase().endsWith(org.eclipse.jgit.lib.Constants.DOT_GIT_EXT)) {
                repository.name += org.eclipse.jgit.lib.Constants.DOT_GIT_EXT;
            }
            if (new File(repositoriesFolder, repository.name).exists()) {
                throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                        "Can not create repository ''{0}'' because it already exists.",
                        repository.name));
            }
            // create repository
            logger.info("create repository " + repository.name);
            r = JGitUtils.createRepository(repositoriesFolder, repository.name);
        } else {
            // rename repository
            if (!repositoryName.equalsIgnoreCase(repository.name)) {
                closeRepository(repositoryName);
                File folder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
                File destFolder = new File(repositoriesFolder, repository.name);
                if (destFolder.exists()) {
                    throw new GitBlitException(
                            MessageFormat
                                    .format("Can not rename repository ''{0}'' to ''{1}'' because ''{1}'' already exists.",
                                            repositoryName, repository.name));
                }
                if (!folder.renameTo(destFolder)) {
                    throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                            "Failed to rename repository ''{0}'' to ''{1}''.", repositoryName,
                            repository.name));
                }
                // rename the roles
                if (!userService.renameRepositoryRole(repositoryName, repository.name)) {
                    throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                            "Failed to rename repository permissions ''{0}'' to ''{1}''.",
                            repositoryName, repository.name));
                }
 
                // clear the cache
                clearRepositoryCache(repositoryName);
            }
 
            // load repository
            logger.info("edit repository " + repository.name);
            try {
                r = repositoryResolver.open(null, repository.name);
            } catch (RepositoryNotFoundException e) {
                logger.error("Repository not found", e);
            } catch (ServiceNotAuthorizedException e) {
                logger.error("Service not authorized", e);
            } catch (ServiceNotEnabledException e) {
                logger.error("Service not enabled", e);
            }
        }
 
        // update settings
        if (r != null) {
            updateConfiguration(r, repository);
            r.close();
        }
    }
 
    /**
     * Updates the Gitblit configuration for the specified repository.
     * 
     * @param r
     *            the Git repository
     * @param repository
     *            the Gitblit repository model
     */
    public void updateConfiguration(Repository r, RepositoryModel repository) {
        StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
        config.setString("gitblit", null, "description", repository.description);
        config.setString("gitblit", null, "owner", repository.owner);
        config.setBoolean("gitblit", null, "useTickets", repository.useTickets);
        config.setBoolean("gitblit", null, "useDocs", repository.useDocs);
        config.setString("gitblit", null, "accessRestriction", repository.accessRestriction.name());
        config.setBoolean("gitblit", null, "showRemoteBranches", repository.showRemoteBranches);
        config.setBoolean("gitblit", null, "isFrozen", repository.isFrozen);
        config.setBoolean("gitblit", null, "showReadme", repository.showReadme);
        config.setBoolean("gitblit", null, "skipSizeCalculation", repository.skipSizeCalculation);
        config.setStringList("gitblit", null, "federationSets", repository.federationSets);
        config.setString("gitblit", null, "federationStrategy",
                repository.federationStrategy.name());
        config.setBoolean("gitblit", null, "isFederated", repository.isFederated);
        try {
            config.save();
        } catch (IOException e) {
            logger.error("Failed to save repository config!", e);
        }
    }
 
    /**
     * Deletes the repository from the file system and removes the repository
     * permission from all repository users.
     * 
     * @param model
     * @return true if successful
     */
    public boolean deleteRepositoryModel(RepositoryModel model) {
        return deleteRepository(model.name);
    }
 
    /**
     * Deletes the repository from the file system and removes the repository
     * permission from all repository users.
     * 
     * @param repositoryName
     * @return true if successful
     */
    public boolean deleteRepository(String repositoryName) {
        try {
            closeRepository(repositoryName);
            File folder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
            if (folder.exists() && folder.isDirectory()) {
                FileUtils.delete(folder, FileUtils.RECURSIVE | FileUtils.RETRY);
                if (userService.deleteRepositoryRole(repositoryName)) {
                    return true;
                }
            }
 
            // clear the repository cache
            clearRepositoryCache(repositoryName);
        } catch (Throwable t) {
            logger.error(MessageFormat.format("Failed to delete repository {0}", repositoryName), t);
        }
        return false;
    }
 
    /**
     * Returns an html version of the commit message with any global or
     * repository-specific regular expression substitution applied.
     * 
     * @param repositoryName
     * @param text
     * @return html version of the commit message
     */
    public String processCommitMessage(String repositoryName, String text) {
        String html = StringUtils.breakLinesForHtml(text);
        Map<String, String> map = new HashMap<String, String>();
        // global regex keys
        if (settings.getBoolean(Keys.regex.global, false)) {
            for (String key : settings.getAllKeys(Keys.regex.global)) {
                if (!key.equals(Keys.regex.global)) {
                    String subKey = key.substring(key.lastIndexOf('.') + 1);
                    map.put(subKey, settings.getString(key, ""));
                }
            }
        }
 
        // repository-specific regex keys
        List<String> keys = settings.getAllKeys(Keys.regex._ROOT + "."
                + repositoryName.toLowerCase());
        for (String key : keys) {
            String subKey = key.substring(key.lastIndexOf('.') + 1);
            map.put(subKey, settings.getString(key, ""));
        }
 
        for (Entry<String, String> entry : map.entrySet()) {
            String definition = entry.getValue().trim();
            String[] chunks = definition.split("!!!");
            if (chunks.length == 2) {
                html = html.replaceAll(chunks[0], chunks[1]);
            } else {
                logger.warn(entry.getKey()
                        + " improperly formatted.  Use !!! to separate match from replacement: "
                        + definition);
            }
        }
        return html;
    }
 
    /**
     * Returns Gitblit's scheduled executor service for scheduling tasks.
     * 
     * @return scheduledExecutor
     */
    public ScheduledExecutorService executor() {
        return scheduledExecutor;
    }
 
    public static boolean canFederate() {
        String passphrase = getString(Keys.federation.passphrase, "");
        return !StringUtils.isEmpty(passphrase);
    }
 
    /**
     * Configures this Gitblit instance to pull any registered federated gitblit
     * instances.
     */
    private void configureFederation() {
        boolean validPassphrase = true;
        String passphrase = settings.getString(Keys.federation.passphrase, "");
        if (StringUtils.isEmpty(passphrase)) {
            logger.warn("Federation passphrase is blank! This server can not be PULLED from.");
            validPassphrase = false;
        }
        if (validPassphrase) {
            // standard tokens
            for (FederationToken tokenType : FederationToken.values()) {
                logger.info(MessageFormat.format("Federation {0} token = {1}", tokenType.name(),
                        getFederationToken(tokenType)));
            }
 
            // federation set tokens
            for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
                logger.info(MessageFormat.format("Federation Set {0} token = {1}", set,
                        getFederationToken(set)));
            }
        }
 
        // Schedule the federation executor
        List<FederationModel> registrations = getFederationRegistrations();
        if (registrations.size() > 0) {
            FederationPullExecutor executor = new FederationPullExecutor(registrations, true);
            scheduledExecutor.schedule(executor, 1, TimeUnit.MINUTES);
        }
    }
 
    /**
     * Returns the list of federated gitblit instances that this instance will
     * try to pull.
     * 
     * @return list of registered gitblit instances
     */
    public List<FederationModel> getFederationRegistrations() {
        if (federationRegistrations.isEmpty()) {
            federationRegistrations.addAll(FederationUtils.getFederationRegistrations(settings));
        }
        return federationRegistrations;
    }
 
    /**
     * Retrieve the specified federation registration.
     * 
     * @param name
     *            the name of the registration
     * @return a federation registration
     */
    public FederationModel getFederationRegistration(String url, String name) {
        // check registrations
        for (FederationModel r : getFederationRegistrations()) {
            if (r.name.equals(name) && r.url.equals(url)) {
                return r;
            }
        }
 
        // check the results
        for (FederationModel r : getFederationResultRegistrations()) {
            if (r.name.equals(name) && r.url.equals(url)) {
                return r;
            }
        }
        return null;
    }
 
    /**
     * Returns the list of federation sets.
     * 
     * @return list of federation sets
     */
    public List<FederationSet> getFederationSets(String gitblitUrl) {
        List<FederationSet> list = new ArrayList<FederationSet>();
        // generate standard tokens
        for (FederationToken type : FederationToken.values()) {
            FederationSet fset = new FederationSet(type.toString(), type, getFederationToken(type));
            fset.repositories = getRepositories(gitblitUrl, fset.token);
            list.add(fset);
        }
        // generate tokens for federation sets
        for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
            FederationSet fset = new FederationSet(set, FederationToken.REPOSITORIES,
                    getFederationToken(set));
            fset.repositories = getRepositories(gitblitUrl, fset.token);
            list.add(fset);
        }
        return list;
    }
 
    /**
     * Returns the list of possible federation tokens for this Gitblit instance.
     * 
     * @return list of federation tokens
     */
    public List<String> getFederationTokens() {
        List<String> tokens = new ArrayList<String>();
        // generate standard tokens
        for (FederationToken type : FederationToken.values()) {
            tokens.add(getFederationToken(type));
        }
        // generate tokens for federation sets
        for (String set : settings.getStrings(Keys.federation.sets)) {
            tokens.add(getFederationToken(set));
        }
        return tokens;
    }
 
    /**
     * Returns the specified federation token for this Gitblit instance.
     * 
     * @param type
     * @return a federation token
     */
    public String getFederationToken(FederationToken type) {
        return getFederationToken(type.name());
    }
 
    /**
     * Returns the specified federation token for this Gitblit instance.
     * 
     * @param value
     * @return a federation token
     */
    public String getFederationToken(String value) {
        String passphrase = settings.getString(Keys.federation.passphrase, "");
        return StringUtils.getSHA1(passphrase + "-" + value);
    }
 
    /**
     * Compares the provided token with this Gitblit instance's tokens and
     * determines if the requested permission may be granted to the token.
     * 
     * @param req
     * @param token
     * @return true if the request can be executed
     */
    public boolean validateFederationRequest(FederationRequest req, String token) {
        String all = getFederationToken(FederationToken.ALL);
        String unr = getFederationToken(FederationToken.USERS_AND_REPOSITORIES);
        String jur = getFederationToken(FederationToken.REPOSITORIES);
        switch (req) {
        case PULL_REPOSITORIES:
            return token.equals(all) || token.equals(unr) || token.equals(jur);
        case PULL_USERS:
            return token.equals(all) || token.equals(unr);
        case PULL_SETTINGS:
            return token.equals(all);
        }
        return false;
    }
 
    /**
     * Acknowledge and cache the status of a remote Gitblit instance.
     * 
     * @param identification
     *            the identification of the pulling Gitblit instance
     * @param registration
     *            the registration from the pulling Gitblit instance
     * @return true if acknowledged
     */
    public boolean acknowledgeFederationStatus(String identification, FederationModel registration) {
        // reset the url to the identification of the pulling Gitblit instance
        registration.url = identification;
        String id = identification;
        if (!StringUtils.isEmpty(registration.folder)) {
            id += "-" + registration.folder;
        }
        federationPullResults.put(id, registration);
        return true;
    }
 
    /**
     * Returns the list of registration results.
     * 
     * @return the list of registration results
     */
    public List<FederationModel> getFederationResultRegistrations() {
        return new ArrayList<FederationModel>(federationPullResults.values());
    }
 
    /**
     * Submit a federation proposal. The proposal is cached locally and the
     * Gitblit administrator(s) are notified via email.
     * 
     * @param proposal
     *            the proposal
     * @param gitblitUrl
     *            the url of your gitblit instance to send an email to
     *            administrators
     * @return true if the proposal was submitted
     */
    public boolean submitFederationProposal(FederationProposal proposal, String gitblitUrl) {
        // convert proposal to json
        String json = JsonUtils.toJsonString(proposal);
 
        try {
            // make the proposals folder
            File proposalsFolder = new File(getString(Keys.federation.proposalsFolder, "proposals")
                    .trim());
            proposalsFolder.mkdirs();
 
            // cache json to a file
            File file = new File(proposalsFolder, proposal.token + Constants.PROPOSAL_EXT);
            com.gitblit.utils.FileUtils.writeContent(file, json);
        } catch (Exception e) {
            logger.error(MessageFormat.format("Failed to cache proposal from {0}", proposal.url), e);
        }
 
        // send an email, if possible
        try {
            Message message = mailExecutor.createMessageForAdministrators();
            if (message != null) {
                message.setSubject("Federation proposal from " + proposal.url);
                message.setText("Please review the proposal @ " + gitblitUrl + "/proposal/"
                        + proposal.token);
                mailExecutor.queue(message);
            }
        } catch (Throwable t) {
            logger.error("Failed to notify administrators of proposal", t);
        }
        return true;
    }
 
    /**
     * Returns the list of pending federation proposals
     * 
     * @return list of federation proposals
     */
    public List<FederationProposal> getPendingFederationProposals() {
        List<FederationProposal> list = new ArrayList<FederationProposal>();
        File folder = new File(getString(Keys.federation.proposalsFolder, "proposals").trim());
        if (folder.exists()) {
            File[] files = folder.listFiles(new FileFilter() {
                @Override
                public boolean accept(File file) {
                    return file.isFile()
                            && file.getName().toLowerCase().endsWith(Constants.PROPOSAL_EXT);
                }
            });
            for (File file : files) {
                String json = com.gitblit.utils.FileUtils.readContent(file, null);
                FederationProposal proposal = JsonUtils.fromJsonString(json,
                        FederationProposal.class);
                list.add(proposal);
            }
        }
        return list;
    }
 
    /**
     * Get repositories for the specified token.
     * 
     * @param gitblitUrl
     *            the base url of this gitblit instance
     * @param token
     *            the federation token
     * @return a map of <cloneurl, RepositoryModel>
     */
    public Map<String, RepositoryModel> getRepositories(String gitblitUrl, String token) {
        Map<String, String> federationSets = new HashMap<String, String>();
        for (String set : getStrings(Keys.federation.sets)) {
            federationSets.put(getFederationToken(set), set);
        }
 
        // Determine the Gitblit clone url
        StringBuilder sb = new StringBuilder();
        sb.append(gitblitUrl);
        sb.append(Constants.GIT_PATH);
        sb.append("{0}");
        String cloneUrl = sb.toString();
 
        // Retrieve all available repositories
        UserModel user = new UserModel(Constants.FEDERATION_USER);
        user.canAdmin = true;
        List<RepositoryModel> list = getRepositoryModels(user);
 
        // create the [cloneurl, repositoryModel] map
        Map<String, RepositoryModel> repositories = new HashMap<String, RepositoryModel>();
        for (RepositoryModel model : list) {
            // by default, setup the url for THIS repository
            String url = MessageFormat.format(cloneUrl, model.name);
            switch (model.federationStrategy) {
            case EXCLUDE:
                // skip this repository
                continue;
            case FEDERATE_ORIGIN:
                // federate the origin, if it is defined
                if (!StringUtils.isEmpty(model.origin)) {
                    url = model.origin;
                }
                break;
            }
 
            if (federationSets.containsKey(token)) {
                // include repositories only for federation set
                String set = federationSets.get(token);
                if (model.federationSets.contains(set)) {
                    repositories.put(url, model);
                }
            } else {
                // standard federation token for ALL
                repositories.put(url, model);
            }
        }
        return repositories;
    }
 
    /**
     * Creates a proposal from the token.
     * 
     * @param gitblitUrl
     *            the url of this Gitblit instance
     * @param token
     * @return a potential proposal
     */
    public FederationProposal createFederationProposal(String gitblitUrl, String token) {
        FederationToken tokenType = FederationToken.REPOSITORIES;
        for (FederationToken type : FederationToken.values()) {
            if (token.equals(getFederationToken(type))) {
                tokenType = type;
                break;
            }
        }
        Map<String, RepositoryModel> repositories = getRepositories(gitblitUrl, token);
        FederationProposal proposal = new FederationProposal(gitblitUrl, tokenType, token,
                repositories);
        return proposal;
    }
 
    /**
     * Returns the proposal identified by the supplied token.
     * 
     * @param token
     * @return the specified proposal or null
     */
    public FederationProposal getPendingFederationProposal(String token) {
        List<FederationProposal> list = getPendingFederationProposals();
        for (FederationProposal proposal : list) {
            if (proposal.token.equals(token)) {
                return proposal;
            }
        }
        return null;
    }
 
    /**
     * Deletes a pending federation proposal.
     * 
     * @param a
     *            proposal
     * @return true if the proposal was deleted
     */
    public boolean deletePendingFederationProposal(FederationProposal proposal) {
        File folder = new File(getString(Keys.federation.proposalsFolder, "proposals").trim());
        File file = new File(folder, proposal.token + Constants.PROPOSAL_EXT);
        return file.delete();
    }
 
    /**
     * Notify the administrators by email.
     * 
     * @param subject
     * @param message
     */
    public void notifyAdministrators(String subject, String message) {
        try {
            Message mail = mailExecutor.createMessageForAdministrators();
            if (mail != null) {
                mail.setSubject(subject);
                mail.setText(message);
                mailExecutor.queue(mail);
            }
        } catch (MessagingException e) {
            logger.error("Messaging error", e);
        }
    }
 
    /**
     * Returns the descriptions/comments of the Gitblit config settings.
     * 
     * @return Map<String, SettingModel>
     */
    public Map<String, SettingModel> getSettingModels() {
        // ensure that the current values are updated in the setting models
        for (String key : settings.getAllKeys(null)) {
            if (settingModels.containsKey(key)) {
                settingModels.get(key).currentValue = settings.getString(key, "");
            }
        }
        return settingModels;
    }
 
    /**
     * Parse the properties file and aggregate all the comments by the setting
     * key. A setting model tracks the current value, the default value, the
     * description of the setting and and directives about the setting.
     * 
     * @return Map<String, SettingModel>
     */
    private Map<String, SettingModel> loadSettingModels() {
        Map<String, SettingModel> map = new TreeMap<String, SettingModel>();
        try {
            // Read bundled Gitblit properties to extract setting descriptions.
            // This copy is pristine and only used for populating the setting
            // models map.
            InputStream is = servletContext.getResourceAsStream("/WEB-INF/gitblit.properties");
            BufferedReader propertiesReader = new BufferedReader(new InputStreamReader(is));
            StringBuilder description = new StringBuilder();
            SettingModel setting = new SettingModel();
            String line = null;
            while ((line = propertiesReader.readLine()) != null) {
                if (line.length() == 0) {
                    description.setLength(0);
                    setting = new SettingModel();
                } else {
                    if (line.charAt(0) == '#') {
                        if (line.length() > 1) {
                            String text = line.substring(1).trim();
                            if (SettingModel.CASE_SENSITIVE.equals(text)) {
                                setting.caseSensitive = true;
                            } else if (SettingModel.RESTART_REQUIRED.equals(text)) {
                                setting.restartRequired = true;
                            } else if (SettingModel.SPACE_DELIMITED.equals(text)) {
                                setting.spaceDelimited = true;
                            } else if (text.startsWith(SettingModel.SINCE)) {
                                try {
                                    setting.since = text.split(" ")[1];
                                } catch (Exception e) {
                                    setting.since = text;
                                }
                            } else {
                                description.append(text);
                                description.append('\n');
                            }
                        }
                    } else {
                        String[] kvp = line.split("=", 2);
                        String key = kvp[0].trim();
                        setting.name = key;
                        setting.defaultValue = kvp[1].trim();
                        setting.currentValue = setting.defaultValue;
                        setting.description = description.toString().trim();
                        map.put(key, setting);
                        description.setLength(0);
                        setting = new SettingModel();
                    }
                }
            }
            propertiesReader.close();
        } catch (NullPointerException e) {
            logger.error("Failed to find resource copy of gitblit.properties");
        } catch (IOException e) {
            logger.error("Failed to load resource copy of gitblit.properties");
        }
        return map;
    }
 
    /**
     * Configure the Gitblit singleton with the specified settings source. This
     * source may be file settings (Gitblit GO) or may be web.xml settings
     * (Gitblit WAR).
     * 
     * @param settings
     */
    public void configureContext(IStoredSettings settings, boolean startFederation) {
        logger.info("Reading configuration from " + settings.toString());
        this.settings = settings;
        repositoriesFolder = new File(settings.getString(Keys.git.repositoriesFolder, "git"));
        logger.info("Git repositories folder " + repositoriesFolder.getAbsolutePath());
        repositoryResolver = new FileResolver<Void>(repositoriesFolder, exportAll);
        serverStatus = new ServerStatus();
        String realm = settings.getString(Keys.realm.userService, "users.properties");
        IUserService loginService = null;
        try {
            // check to see if this "file" is a login service class
            Class<?> realmClass = Class.forName(realm);
            if (IUserService.class.isAssignableFrom(realmClass)) {
                loginService = (IUserService) realmClass.newInstance();
            }
        } catch (Throwable t) {
            // not a login service class or class could not be instantiated.
            // try to use default file login service
            File realmFile = new File(realm);
            if (!realmFile.exists()) {
                try {
                    realmFile.createNewFile();
                } catch (IOException x) {
                    logger.error(
                            MessageFormat.format("COULD NOT CREATE REALM FILE {0}!", realmFile), x);
                }
            }
            loginService = new FileUserService(realmFile);
        }
        setUserService(loginService);
        mailExecutor = new MailExecutor(settings);
        if (mailExecutor.isReady()) {
            scheduledExecutor.scheduleAtFixedRate(mailExecutor, 1, 2, TimeUnit.MINUTES);
        } else {
            logger.warn("Mail server is not properly configured.  Mail services disabled.");
        }
        if (startFederation) {
            configureFederation();
        }
    }
 
    /**
     * Configure Gitblit from the web.xml, if no configuration has already been
     * specified.
     * 
     * @see ServletContextListener.contextInitialize(ServletContextEvent)
     */
    @Override
    public void contextInitialized(ServletContextEvent contextEvent) {
        servletContext = contextEvent.getServletContext();
        settingModels = loadSettingModels();
        if (settings == null) {
            // Gitblit WAR is running in a servlet container
            WebXmlSettings webxmlSettings = new WebXmlSettings(contextEvent.getServletContext());
            configureContext(webxmlSettings, true);
        }
    }
 
    /**
     * Gitblit is being shutdown either because the servlet container is
     * shutting down or because the servlet container is re-deploying Gitblit.
     */
    @Override
    public void contextDestroyed(ServletContextEvent contextEvent) {
        logger.info("Gitblit context destroyed by servlet container.");
        scheduledExecutor.shutdownNow();
    }
}