James Moger
2012-09-10 fabe060d3a435f116128851f828e35c2af5fde67
src/com/gitblit/GitBlit.java
@@ -37,12 +37,14 @@
import java.util.Map.Entry;
import java.util.Set;
import java.util.TimeZone;
import java.util.TreeMap;
import java.util.TreeSet;
import java.util.concurrent.ConcurrentHashMap;
import java.util.concurrent.Executors;
import java.util.concurrent.ScheduledExecutorService;
import java.util.concurrent.TimeUnit;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicInteger;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicReference;
import javax.mail.Message;
import javax.mail.MessagingException;
@@ -56,6 +58,7 @@
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
import org.eclipse.jgit.lib.RepositoryCache.FileKey;
import org.eclipse.jgit.lib.StoredConfig;
import org.eclipse.jgit.storage.file.FileBasedConfig;
import org.eclipse.jgit.storage.file.WindowCache;
import org.eclipse.jgit.storage.file.WindowCacheConfig;
import org.eclipse.jgit.transport.ServiceMayNotContinueException;
@@ -77,6 +80,7 @@
import com.gitblit.models.FederationProposal;
import com.gitblit.models.FederationSet;
import com.gitblit.models.Metric;
import com.gitblit.models.ProjectModel;
import com.gitblit.models.RepositoryModel;
import com.gitblit.models.SearchResult;
import com.gitblit.models.ServerSettings;
@@ -86,6 +90,8 @@
import com.gitblit.models.UserModel;
import com.gitblit.utils.ArrayUtils;
import com.gitblit.utils.ByteFormat;
import com.gitblit.utils.ContainerUtils;
import com.gitblit.utils.DeepCopier;
import com.gitblit.utils.FederationUtils;
import com.gitblit.utils.JGitUtils;
import com.gitblit.utils.JsonUtils;
@@ -125,6 +131,12 @@
   private final ObjectCache<Long> repositorySizeCache = new ObjectCache<Long>();
   private final ObjectCache<List<Metric>> repositoryMetricsCache = new ObjectCache<List<Metric>>();
   private final Map<String, RepositoryModel> repositoryListCache = new ConcurrentHashMap<String, RepositoryModel>();
   private final Map<String, ProjectModel> projectCache = new ConcurrentHashMap<String, ProjectModel>();
   private final AtomicReference<String> repositoryListSettingsChecksum = new AtomicReference<String>("");
   private RepositoryResolver<Void> repositoryResolver;
@@ -145,6 +157,8 @@
   private LuceneExecutor luceneExecutor;
   
   private TimeZone timezone;
   private FileBasedConfig projectConfigs;
   public GitBlit() {
      if (gitblit == null) {
@@ -723,15 +737,80 @@
   public boolean deleteTeam(String teamname) {
      return userService.deleteTeam(teamname);
   }
   /**
    * Adds the repository to the list of cached repositories if Gitblit is
    * configured to cache the repository list.
    *
    * @param name
    */
   private void addToCachedRepositoryList(String name, RepositoryModel model) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         repositoryListCache.put(name, model);
      }
   }
   /**
    * Removes the repository from the list of cached repositories.
    *
    * @param name
    */
   private void removeFromCachedRepositoryList(String name) {
      if (StringUtils.isEmpty(name)) {
         return;
      }
      repositoryListCache.remove(name);
   }
   /**
    * Clears all the cached data for the specified repository.
    * Clears all the cached metadata for the specified repository.
    * 
    * @param repositoryName
    */
   public void clearRepositoryCache(String repositoryName) {
   private void clearRepositoryMetadataCache(String repositoryName) {
      repositorySizeCache.remove(repositoryName);
      repositoryMetricsCache.remove(repositoryName);
   }
   /**
    * Resets the repository list cache.
    *
    */
   public void resetRepositoryListCache() {
      logger.info("Repository cache manually reset");
      repositoryListCache.clear();
   }
   /**
    * Calculate the checksum of settings that affect the repository list cache.
    * @return a checksum
    */
   private String getRepositoryListSettingsChecksum() {
      StringBuilder ns = new StringBuilder();
      ns.append(settings.getString(Keys.git.cacheRepositoryList, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchRecursionDepth, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchExclusions, "")).append('\n');
      String checksum = StringUtils.getSHA1(ns.toString());
      return checksum;
   }
   /**
    * Compare the last repository list setting checksum to the current checksum.
    * If different then clear the cache so that it may be rebuilt.
    *
    * @return true if the cached repository list is valid since the last check
    */
   private boolean isValidRepositoryList() {
      String newChecksum = getRepositoryListSettingsChecksum();
      boolean valid = newChecksum.equals(repositoryListSettingsChecksum.get());
      repositoryListSettingsChecksum.set(newChecksum);
      if (!valid && settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Repository list settings have changed. Clearing repository list cache.");
         repositoryListCache.clear();
      }
      return valid;
   }
   /**
@@ -741,11 +820,48 @@
    * @return list of all repositories
    */
   public List<String> getRepositoryList() {
      return JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder,
            settings.getBoolean(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, false),
            settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true),
            settings.getInteger(Keys.git.searchRecursionDepth, -1),
            settings.getStrings(Keys.git.searchExclusions));
      if (repositoryListCache.size() == 0 || !isValidRepositoryList()) {
         // we are not caching OR we have not yet cached OR the cached list is invalid
         long startTime = System.currentTimeMillis();
         List<String> repositories = JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder,
               settings.getBoolean(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, false),
               settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true),
               settings.getInteger(Keys.git.searchRecursionDepth, -1),
               settings.getStrings(Keys.git.searchExclusions));
         if (!settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
            // we are not caching
            StringUtils.sortRepositorynames(repositories);
            return repositories;
         } else {
            // we are caching this list
            String msg = "{0} repositories identified in {1} msecs";
            // optionally (re)calculate repository sizes
            if (getBoolean(Keys.web.showRepositorySizes, true)) {
               msg = "{0} repositories identified with calculated folder sizes in {1} msecs";
               for (String repository : repositories) {
                  RepositoryModel model = getRepositoryModel(repository);
                  if (!model.skipSizeCalculation) {
                     calculateSize(model);
                  }
               }
            } else {
               // update cache
               for (String repository : repositories) {
                  getRepositoryModel(repository);
               }
            }
            long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
            logger.info(MessageFormat.format(msg, repositoryListCache.size(), duration));
         }
      }
      // return sorted copy of cached list
      List<String> list = new ArrayList<String>(repositoryListCache.keySet());
      StringUtils.sortRepositorynames(list);
      return list;
   }
   /**
@@ -804,6 +920,7 @@
    * @return list of repository models accessible to user
    */
   public List<RepositoryModel> getRepositoryModels(UserModel user) {
      long methodStart = System.currentTimeMillis();
      List<String> list = getRepositoryList();
      List<RepositoryModel> repositories = new ArrayList<RepositoryModel>();
      for (String repo : list) {
@@ -823,9 +940,15 @@
            }
         }
         long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
         logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
         if (duration > 250) {
            // only log calcualtion time if > 250 msecs
            logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
               repoCount, duration));
         }
      }
      long duration = System.currentTimeMillis() - methodStart;
      logger.info(MessageFormat.format("{0} repository models loaded for {1} in {2} msecs",
            repositories.size(), user == null ? "anonymous" : user.username, duration));
      return repositories;
   }
@@ -860,6 +983,203 @@
    * @return repository model or null
    */
   public RepositoryModel getRepositoryModel(String repositoryName) {
      if (!repositoryListCache.containsKey(repositoryName)) {
         RepositoryModel model = loadRepositoryModel(repositoryName);
         if (model == null) {
            return null;
         }
         addToCachedRepositoryList(repositoryName, model);
         return model;
      }
      // cached model
      RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repositoryName);
      // check for updates
      Repository r = getRepository(repositoryName);
      if (r == null) {
         // repository is missing
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         logger.error(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" is missing! Removing from cache.", repositoryName));
         return null;
      }
      FileBasedConfig config = (FileBasedConfig) getRepositoryConfig(r);
      if (config.isOutdated()) {
         // reload model
         logger.info(MessageFormat.format("Config for \"{0}\" has changed. Reloading model and updating cache.", repositoryName));
         model = loadRepositoryModel(repositoryName);
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         addToCachedRepositoryList(repositoryName, model);
      } else {
         // update a few repository parameters
         if (!model.hasCommits) {
            // update hasCommits, assume a repository only gains commits :)
            model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
         }
         model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r);
      }
      r.close();
      // return a copy of the cached model
      return DeepCopier.copy(model);
   }
   /**
    * Returns the map of project config.  This map is cached and reloaded if
    * the underlying projects.conf file changes.
    *
    * @return project config map
    */
   private Map<String, ProjectModel> getProjectConfigs() {
      if (projectConfigs.isOutdated()) {
         try {
            projectConfigs.load();
         } catch (Exception e) {
         }
         // project configs
         String rootName = GitBlit.getString(Keys.web.repositoryRootGroupName, "main");
         ProjectModel rootProject = new ProjectModel(rootName, true);
         Map<String, ProjectModel> configs = new HashMap<String, ProjectModel>();
         // cache the root project under its alias and an empty path
         configs.put("", rootProject);
         configs.put(rootProject.name.toLowerCase(), rootProject);
         for (String name : projectConfigs.getSubsections("project")) {
            ProjectModel project;
            if (name.equalsIgnoreCase(rootName)) {
               project = rootProject;
            } else {
               project = new ProjectModel(name);
            }
            project.title = projectConfigs.getString("project", name, "title");
            project.description = projectConfigs.getString("project", name, "description");
            // TODO add more interesting metadata
            // project manager?
            // commit message regex?
            // RW+
            // RW
            // R
            configs.put(name.toLowerCase(), project);
         }
         projectCache.clear();
         projectCache.putAll(configs);
      }
      return projectCache;
   }
   /**
    * Returns a list of project models for the user.
    *
    * @param user
    * @return list of projects that are accessible to the user
    */
   public List<ProjectModel> getProjectModels(UserModel user) {
      Map<String, ProjectModel> configs = getProjectConfigs();
      // per-user project lists, this accounts for security and visibility
      Map<String, ProjectModel> map = new TreeMap<String, ProjectModel>();
      // root project
      map.put("", configs.get(""));
      for (RepositoryModel model : getRepositoryModels(user)) {
         String rootPath = StringUtils.getRootPath(model.name).toLowerCase();
         if (!map.containsKey(rootPath)) {
            ProjectModel project;
            if (configs.containsKey(rootPath)) {
               // clone the project model because it's repository list will
               // be tailored for the requesting user
               project = DeepCopier.copy(configs.get(rootPath));
            } else {
               project = new ProjectModel(rootPath);
            }
            map.put(rootPath, project);
         }
         map.get(rootPath).addRepository(model);
      }
      // sort projects, root project first
      List<ProjectModel> projects = new ArrayList<ProjectModel>(map.values());
      Collections.sort(projects);
      projects.remove(map.get(""));
      projects.add(0, map.get(""));
      return projects;
   }
   /**
    * Returns the project model for the specified user.
    *
    * @param name
    * @param user
    * @return a project model, or null if it does not exist
    */
   public ProjectModel getProjectModel(String name, UserModel user) {
      for (ProjectModel project : getProjectModels(user)) {
         if (project.name.equalsIgnoreCase(name)) {
            return project;
         }
      }
      return null;
   }
   /**
    * Returns a project model for the Gitblit/system user.
    *
    * @param name a project name
    * @return a project model or null if the project does not exist
    */
   public ProjectModel getProjectModel(String name) {
      Map<String, ProjectModel> configs = getProjectConfigs();
      ProjectModel project = configs.get(name.toLowerCase());
      if (project == null) {
         return null;
      }
      // clone the object
      project = DeepCopier.copy(project);
      String folder = name.toLowerCase() + "/";
      for (String repository : getRepositoryList()) {
         if (repository.toLowerCase().startsWith(folder)) {
            project.addRepository(repository);
         }
      }
      return project;
   }
   /**
    * Workaround JGit.  I need to access the raw config object directly in order
    * to see if the config is dirty so that I can reload a repository model.
    * If I use the stock JGit method to get the config it already reloads the
    * config.  If the config changes are made within Gitblit this is fine as
    * the returned config will still be flagged as dirty.  BUT... if the config
    * is manipulated outside Gitblit then it fails to recognize this as dirty.
    *
    * @param r
    * @return a config
    */
   private StoredConfig getRepositoryConfig(Repository r) {
      try {
         Field f = r.getClass().getDeclaredField("repoConfig");
         f.setAccessible(true);
         StoredConfig config = (StoredConfig) f.get(r);
         return config;
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Failed to retrieve \"repoConfig\" via reflection", e);
      }
      return r.getConfig();
   }
   /**
    * Create a repository model from the configuration and repository data.
    *
    * @param repositoryName
    * @return a repositoryModel or null if the repository does not exist
    */
   private RepositoryModel loadRepositoryModel(String repositoryName) {
      Repository r = getRepository(repositoryName);
      if (r == null) {
         return null;
@@ -869,7 +1189,8 @@
      model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
      model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r);
      model.isBare = r.isBare();
      StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
      StoredConfig config = r.getConfig();
      if (config != null) {
         model.description = getConfig(config, "description", "");
         model.owner = getConfig(config, "owner", "");
@@ -909,6 +1230,26 @@
      model.availableRefs = JGitUtils.getAvailableHeadTargets(r);
      r.close();
      return model;
   }
   /**
    * Determines if this server has the requested repository.
    *
    * @param name
    * @return true if the repository exists
    */
   public boolean hasRepository(String repositoryName) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         // if we are caching use the cache to determine availability
         // otherwise we end up adding a phantom repository to the cache
         return repositoryListCache.containsKey(repositoryName);
      }
      Repository r = getRepository(repositoryName, false);
      if (r == null) {
         return false;
      }
      r.close();
      return true;
   }
   /**
@@ -1086,7 +1427,7 @@
            }
            // clear the cache
            clearRepositoryCache(repositoryName);
            clearRepositoryMetadataCache(repositoryName);
         }
         // load repository
@@ -1114,15 +1455,20 @@
                  repository.name, currentRef, repository.HEAD));
            if (JGitUtils.setHEADtoRef(r, repository.HEAD)) {
               // clear the cache
               clearRepositoryCache(repository.name);
               clearRepositoryMetadataCache(repository.name);
            }
         }
         // close the repository object
         r.close();
      }
      // update repository cache
      removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
      // model will actually be replaced on next load because config is stale
      addToCachedRepositoryList(repository.name, repository);
   }
   /**
    * Updates the Gitblit configuration for the specified repository.
    * 
@@ -1132,7 +1478,7 @@
    *            the Gitblit repository model
    */
   public void updateConfiguration(Repository r, RepositoryModel repository) {
      StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
      StoredConfig config = r.getConfig();
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "description", repository.description);
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "owner", repository.owner);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "useTickets", repository.useTickets);
@@ -1210,16 +1556,18 @@
   public boolean deleteRepository(String repositoryName) {
      try {
         closeRepository(repositoryName);
         // clear the repository cache
         clearRepositoryMetadataCache(repositoryName);
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         File folder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
         if (folder.exists() && folder.isDirectory()) {
            FileUtils.delete(folder, FileUtils.RECURSIVE | FileUtils.RETRY);
            if (userService.deleteRepositoryRole(repositoryName)) {
               logger.info(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" deleted", repositoryName));
               return true;
            }
         }
         // clear the repository cache
         clearRepositoryCache(repositoryName);
      } catch (Throwable t) {
         logger.error(MessageFormat.format("Failed to delete repository {0}", repositoryName), t);
      }
@@ -1938,6 +2286,15 @@
      repositoriesFolder = getRepositoriesFolder();
      logger.info("Git repositories folder " + repositoriesFolder.getAbsolutePath());
      repositoryResolver = new FileResolver<Void>(repositoriesFolder, true);
      // calculate repository list settings checksum for future config changes
      repositoryListSettingsChecksum.set(getRepositoryListSettingsChecksum());
      // build initial repository list
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Identifying available repositories...");
         getRepositoryList();
      }
      
      logTimezone("JVM", TimeZone.getDefault());
      logTimezone(Constants.NAME, getTimezone());
@@ -1953,6 +2310,11 @@
         loginService = new GitblitUserService();
      }
      setUserService(loginService);
      // load and cache the project metadata
      projectConfigs = new FileBasedConfig(getFileOrFolder(Keys.web.projectsFile, "projects.conf"), FS.detect());
      getProjectConfigs();
      mailExecutor = new MailExecutor(settings);
      if (mailExecutor.isReady()) {
         logger.info("Mail executor is scheduled to process the message queue every 2 minutes.");
@@ -1988,6 +2350,8 @@
      } catch (IllegalArgumentException e) {
         logger.error("Failed to configure JGit parameters!", e);
      }
      ContainerUtils.CVE_2007_0450.test();
   }
   
   private void logTimezone(String type, TimeZone zone) {